在高速信號調試時工程師必須首先調試并驗證其設計是否符合物理層規范。在此階段，信號完整性(如眼圖和抖動)是關鍵問題，很多這種驗證和調試是通過使用偽隨機碼序列(PRBS)或循環測試碼，并結合示波器及示波器廠家提供的串行數據眼圖和抖動分析軟件來完成的。

    在確保物理層信號質量沒有問題后，串行信號從測試碼變為8b/10b編碼字符序列，此時系統級問題成為調試的重點，問題可能會出現在物理層-鏈路層域(涉及信號完整性和數據完整性的交叉領域)。這時，就需要對物理層信號實現解碼分析。

    對于現代的高速串行系統，系統之間的協調工作顯得更為突出，協議間的任何沖突也會導致整個系統出現問題，因此分析物理層和鏈路層往往還是不夠的，還必須要對系統的協議層進行分析，這時往往需要用到專用的協議分析儀。